Se hacen pequeñas incisiones en el abdomen y se pasa el endoscopio a través de una de las incisiones. Los instrumentos quirúrgicos se introducen a través de otras incisiones. Se utilizan pequeños clips para cerrar la conexión entre la vesícula biliar y el conducto biliar. La vesícula biliar puede desprenderse del hígado. La vesícula biliar se extirpa a través de una de las incisiones; la bilis todavía fluye desde el hígado hasta el intestino delgado.
Una vez finalizada la cirugía de extirpación de la vesícula biliar, se retiran todas las herramientas y se cierran las incisiones con puntos o grapas. A veces, es posible que sea necesario cambiar una cirugía laparoscópica a una cirugía abierta utilizando una incisión grande. Este cambio puede ocurrir debido a tejido cicatricial, anatomía inusual o por alguna otra razón.